El temps d'eliminació metabòlica de la sibutramina al cos humà normalment oscil·la entre 3 i 5 dies; no obstant això, el temps necessari per a l'eliminació completa s'ha de valorar en funció de les diferències individuals. El fàrmac s'elimina principalment per vies com el metabolisme hepàtic i l'excreció renal; per a les persones que prenen el medicament durant un període prolongat, el procés d'autorització pot trigar més.
Com a medicament per a la pèrdua de pes{0}}que actua de manera central, els metabòlits de la sibutramina es transformen principalment mitjançant el sistema enzimàtic del citocrom P450 hepàtic. Després d'una dosi única en adults sans, la semivida d'eliminació plasmàtica és d'aproximadament 16 hores i més del 80% del fàrmac s'excreta a l'orina en 72 hores. En individus amb funció hepàtica normal, el metabolisme es produeix amb relativa rapidesa, i el fàrmac original normalment esdevé indetectable en 5 a 7 dies. Per als pacients amb malaltia hepàtica crònica, la reducció de l'activitat enzimàtica pot allargar el temps d'eliminació metabòlica de 7 a 10 dies. En pacients amb insuficiència renal, la velocitat d'excreció s'alenteix, la qual cosa requereix un seguiment de les concentracions plasmàtiques del fàrmac per evitar l'acumulació. L'ús crònic a dosis altes pot provocar una acumulació dins del teixit adipós, requerint de 10 a 14 dies per a l'eliminació completa. El procés metabòlic està influenciat per diversos factors-com l'edat, el pes corporal i les condicions mèdiques subjacents-que donen lloc a una variabilitat individual important.
En circumstàncies especials-com ara durant l'embaràs-la barrera placentària pot retardar l'eliminació del fàrmac. En individus amb polimorfismes genètics que resulten en una baixa activitat enzimàtica CYP2B6, l'eficiència metabòlica es pot reduir aproximadament un 40%. Quan s'administra conjuntament amb inhibidors del CYP2D6 (com la fluoxetina), la semivida d'eliminació pot allargar-se a més de 30 hores. En pacients obesos, l'augment del volum de distribució a causa d'un major contingut de greix corporal dóna lloc a una semivida d'eliminació-que és un 25% més llarga que la dels individus amb pes corporal normal. La hipotèrmia postoperatòria pot reduir la taxa metabòlica hepàtica en un 50%, allargant així significativament el temps d'eliminació. En aquestes situacions específiques, s'ha d'avaluar l'estat metabòlic real mitjançant el seguiment de les concentracions plasmàtiques de fàrmacs.
Es recomana a les persones que prenen sibutramina que es sotmetin a avaluacions periòdiques de la seva funció hepàtica i renal i que evitin la co-administració amb inhibidors del CYP3A4, com el suc d'aranja. Durant el període d'eliminació metabòlica, es recomana mantenir una ingesta diària de líquids de 2.000 ml per facilitar l'excreció i prendre suplements adequats de vitamines del complex B-per donar suport a les funcions de desintoxicació hepàtica. Si apareixen símptomes adversos-com palpitacions o marejos-, interrompeu el medicament immediatament i busqueu atenció mèdica; a més, s'ha d'evitar estrictament intentar accelerar artificialment el metabolisme mitjançant mètodes com sessions de sauna o exercici físic intens. Les dones que planegen quedar embarassades han d'interrompre la medicació almenys tres mesos abans d'intentar l'embaràs; l'ús d'aquest medicament està estrictament contraindicat en dones que alleten. Cada dia, les persones poden controlar el seu pes corporal mitjançant opcions de vida saludables-com fer exercici aeròbic i adoptar una dieta alta-en fibra-, reduint així la seva dependència de les intervencions farmacològiques.